锦州市办理港澳通行证方法如下：

提交申请。申请人可先在网上提前预约申请，或直接到现场提出申请。

数码照相。申请人需要提交本人数码照片两张，可直接在现场进行拍照。

采集指纹。申请人在工作人员的指引下进行指纹采集或者核验指纹，岁以下的申请人是否采集指纹根据其监护人的意见确定，采集后拿号等待办理。

受理申请。工作人员对申请人提交的材料进行初审，并出具缴费单给申请人。

缴纳费用。申请人到指定窗口缴纳办证及签注所需的费用，制证费用，签注费用以签注类型而定，并领取回执单。

制作证件。受理申请后，由省公安机关出入境管理机构负责制作电子港澳通行证，并将制作好的证件送回接受申请的出入境管理机构。

发放证件。申请人在制证完成后，到办理的出入境管理机构领取证件;若选择快递形式收件的话，只需等候快递人员上门进行签收即可。