棉花缺硼与土壤硼素供应不足或有效性差有关。耕层浅、质地粗、少雨、干旱，根系对硼的吸收受阻，造成土壤缺硼。偏施氮肥或有机肥施用不足，钙素使用量大、均会导致土壤缺硼。因此，造成棉花“蕾而不花、花而不实”，花铃稀少产量低。

苗期缺硼，顶芽发育停滞、子叶肥厚颜色较深，叶柄较长，下部叶柄长出一个环带，叶子深绿肥大。常萎蔫成“个”字型。严重缺硼时，生长点停止生长，不长真叶。