区别主要是在于溶剂不同。碘伏是水溶性的，而碘酒的溶剂是酒精，所以碘伏的刺激性更小，而碘酒的刺激性很大。

在日常用的时候，口腔黏膜这些比较脆弱的组织是可以用碘伏消毒，而不能用碘酒进行消毒。再一个就是碘酒在干燥以后必须要进行脱碘，因为会造成皮肤的色素沉着，这些碘剂如果在开放的创面附着会影响到创面的愈合。