1、整本小说从开头到林秋石从百鬼夜行里出来都是属于林秋石的第十二扇门的剧情。他在钟表里发现了两个钥匙，虚幻之生和真实之死，虚幻之生代表着永远留在门里，和那些本来已经死去的朋友一起在门里活着；真实之死即回到现实世界，但是没有阮南烛。

2、当时的林秋石以为阮南烛是真实世界的人，他以为自己只是简单的在过第十一扇门，而关于生死的选择是第十二扇门，所以他果断选择了真实之死从第十二扇门出去了。结果阮南烛本就是不存在的人，黑曜石没人认得阮南烛。

3、一年后(其实门里也就几天)，阮南烛出来了，因为他的强行出门真实世界发生了变化，本来不记得他的黑曜石成员也记得他了，但也只是记得，关系上要冷淡许多，所以可以解释番外为什么白铭明明是阮南烛的朋友却仿佛和林秋石更亲近。

4、阮南烛是第十二扇门的门神，在文里阮南烛扮演的角色其实是现实里的林秋石——黑曜石的老大——因为抽烟得了肺癌才进门。

5、作为一个优秀的进门人，林秋石成功引起了终极boss阮南烛的注意，所以决定构造一个虚幻的世界，篡改林秋石的记忆，由他带着林秋石重新过一遍门，这就是林秋石第十二扇门的劫。每个人的第十二扇门都不一样，不是每个人都像林秋石那样有门神的“宠幸”。

6、忘记自己其实是个门神的阮南烛经历着林秋石经历过的一切，被消除记忆的林秋石则成了一个新人，栗子不让抱了，这本书的剧情就是从这里开始的。百鬼夜行以前阮南烛都不知道自己是门神，直到佐子带他去了林秋石以前住过的公寓看了那些电视之后才知道自己不是人。