1、定义不同

石英岩是一种天然形成的晶体矿石，是由粒状石英集合体组成的致密块体，石英含量在90%以上，而水晶是石英岩的一种，它的主要成分是二氧化硅，纯净时形成无色透明的晶体，并根据元素不同产生不同的颜色。

2、性质不同

石英岩具脆性，具有热电性，折射性强，同时石英具有强烈的压电性，即用力敲击摩擦时会产生火花，而水晶石导热性好，很难融化，化学稳定性比较好，在高温高压条件下可溶解于碳酸钠溶液中。

3、形成不同

石英岩是岩浆在侵入演化活动过程中，由于温度、压力等条件的改变，分异出富含二氧化硅的热液，最后形成脉状石英岩矿体，而水晶是要有富含硅质矿物的热液，略偏碱性、盐度较低，同时需要低一高的温度。需要有一定的生长时间形成。